In-Silico analīze monoklonālajām antivielām pret SARS-CoV-2 Omicron
Mar 30, 2022
Kontaktpersona:joanna.jia@wecistanche.com/ WhatsApp: 008618081934791
Abstrakts
PVO Omicron noteica kā GOS 2021. gada 26. novembrī, tikai 4 dienas pēc secības pirmās iesniegšanas. Tomēr Omicron ietekme uz pašreizējām antivielām un vakcīnām joprojām nav zināma, un novērtējumi vēl ir pēc dažām nedēļām. Mēs analizējām mutācijas Omicron variantā pret epitopiem. Mūsu datubāzē 120 antivielu 132 epitopi ir klasificēti piecās grupās, proti, NTD, RBD-1, RBD-2, RBD-3 un RBD-4. Omicron mutācijas ietekmē visus epitopus NTD, RBD-1, RBD-2 un RBD-3, un šīs mutācijas nesaudzē nevienu antivielu epitopu. Tikai četras no 120 antivielām var nodrošināt pilnīgu rezistenci pret mutācijām Omicron smaile, jo visas šo trīs grupu antivielas satur vienu vai vairākus epitopus, kurus ietekmē šīs mutācijas. No visām antivielām saskaņā ar EUA Etesevimab, Bamlanivimab, Casirivimab, Imdevima, Cilgavimab, Tixagevimab, Sotrovimab un Regdanvimab neitralizācijas potenciāls var būt dažādās pakāpēs. Mūsu analīze liecina, ka Omicron smailes mutāciju ietekme uz pašreizējām terapeitiskajām antivielām var attiekties arī uz pašreizējāmCOVID-19 vakcīnas.
Atslēgvārdi: SARS-CoV-2;omikrons; antivielas; vakcīna
1 Biomedicīnas zinātņu skola, Li Ka Shinga Medicīnas fakultāte, Honkongas Universitāte,
Honkonga, Ķīna; yefanhu@connect.hku.hk
2 Honkongas Universitātes Li Ka Šinga Medicīnas fakultātes Medicīnas nodaļa,
Hong Kong, China; tyaucc@hku.hk
3 CAS Galvenā Kvantitatīvās inženierbioloģijas laboratorija, Šenženas Sintētiskās bioloģijas institūts,
Šeņdžeņas progresīvo tehnoloģiju institūti (SIAT), Ķīnas Zinātņu akadēmija,
Shenzhen 518055, Ķīna; jc.hu@siat.ac.cn
4 Honkongas Universitātes Li Ka Shing Medicīnas fakultātes Mikrobioloģijas nodaļa,
Hong Kong, China; hinchu@hku.hk
5 Guandunas-Honkongas Apvienotā RNS medicīnas laboratorija, Sun Yat-Sen University,
Guandžou 510120, Ķīna
1. Ievads
Pašreizējā laikāKoronavīrusa slimība 2019. gads(COVID-19) pandēmijas, ko izraisa smaga akūta respiratorā sindroma koronavīruss 2 (SARS-CoV-2), Pasaules Veselības organizācija (PVO) ir izsekējusi SARS-CoV-2 variantus. bažas izraisošie varianti (GOS), interesējošie varianti (VOI) vai uzraugāmie varianti (VUM) [1]. Iepriekšējie GOS, tostarp alfa (Pango līnija B.1.1.7), beta (B.1.351), gamma (P.1) un delta (B.1.617.2 un AY.*), parasti tika apzīmēti 3 līdz 6 mēnešus pēc to iegūšanas. pirmo reizi tika ziņots. Jaunākais GOS Omicron (B.1.1.529 vai BA.*) tika nosaukts 2021. gada 26. novembrī, tikai 4 dienas pēc tā secības pirmās iesniegšanas [2]. Steidzamu rīcību pamudināja identificēt neparasti daudz mutāciju Omicron smaile, kas ietver 10 mutācijas N-terminālā domēnā (NTD) un 15 mutācijas receptorus saistošajā domēnā (RBD) [3]. Lai gan šādi mutāciju skaitļi aizkavēja ietekmes uz terapeitiskajām antivielām un vakcīnām validāciju.
Šeit mēs novērtējam Omicron smaiļu mutāciju ietekmi uz vakcīnām un antivielām, izmantojot mūsu SARS-CoVs{1}} smaiļu antivielu datubāzi. Mūsu analīze liecina, ka Omicron mutācijas ietekmē visus epitopus NTD, RBD-1, RBD-2 un RBD-3, un šīs mutācijas nesaudzē nevienu antivielu saistīšanās vietu. Tikai četras antivielas UBD-4 var nodrošināt pilnīgu rezistenci pret mutācijām Omicron smaile. No visām antivielām saskaņā ar EUA Etesevimab, Bamlanivimab, Casirivimab, Imdevima, Cilgavimab, Tix-Kageyama, Sotrovimab un Regdanvimab neitralizācijas potenciāls var būt dažādās pakāpēs. Mūsu analīze liecina, ka Omicron smailes mutāciju radītā Omicron ietekme uz pašreizējām terapeitiskajām antivielām var attiekties arī uz pašreizējām Covid-19 vakcīnām.
2. Metodes
Literatūrā apkopojām 132 apstiprinātus konformācijas epitopus ar proteīnu struktūrām, kas atbrīvotas Protein Data Bank (PDB) vai anotētiem epitopu pēdām. Antivielām ar proteīnu struktūrām epitopu atlikumi tika aprēķināti pēc IEDB metodes [6]; pretējā gadījumā daļējas epitopu pozīcijas tika savāktas no atsauces rezultātiem. Sīkāka informācija par visām antivielām ar epitopu pēdām, PBP piekļuves numuriem un atsauces DOI numuriem ir parādīta S1 tabulā. Dažas antivielas dažādos pētījumos uzrāda dažādus epitopus, un mēs tās dokumentējām kā dažādus epitopus. Mēs uzzīmējām smaiļu proteīna epitopus, izmantojot Microsoft Powerpoint.
costanche
Mūsu datubāzē 132 monoklonālo antivielu epitopus var klasificēt piecās antigēnu grupās: NTD [4], RBD-1, RBD-2, RBD-3 un RBD{{6} } [5]. Starp šiem epitopiem. 19 epitopi, ko atpazīst 19 antivielas, ir NTD antigēnu grupā, savukārt UBD ir 114 epitopi, kas saistīti ar 102 antivielām, kuru mērķis ir smaile proteīna UBR. Ir attiecīgi 42, 35, 22 un 14 dokumentēti epitopi antigēnu grupai RBD-1, RBD-2, RBD-3 un RBD-4. Šeit, NTD satur epitopu coyering atlikumus 14-20.27-30.32. 61. 64.66. 68,69,71,76,77,97,98, 124, 140,142-158, 180-183,185-187, 211-218.243-257.259.260. un 262 smailes proteīna; URBD-1 satur epitopus, kas aptver atlikumus 403-408, 414-417, 420. 421. 432. 439-441. 443-450. 452. 453. 455-460. 470-479. 481-496. 498-505. un 508;RBD-2 satur epitopus, kas aptver atlikumus 372, 403, 405, 406, 408, 409,414-417, 420, 421, 440, 444-446,449,450,453,455-460 , 470,471,473-478,481-487,489,490, 492-496, 498 un 500-505;RBD-3 satur epitopus, kas aptver atlikumus 333-335, 337, 339-347, 349, 351, 354-361.67.368.371-376.378.408.409.414.417,436-439.440-452.455.456.470.472.473.475. 478-494, 498-506, 508 un 509; un URB-4 satur epitopus, kas aptver atlikumus 353-357, 359,360,366,369-372,374-386,388-390,392,394,396,404,405,408,409,{}{12} , 437, 462-466, 468, 500-506.508,514-521 un 523.
Mēs izmantojām agrākās ziņotās Omicron Spike sekvences kā atsauci (GISAID pievienošanās numurs EPIISL_6590608 un EPI_ISL_6754457)[2]. Mūsu analīzē antiviela pilnībā pretojas mutācijas Omicron smaile, ja epitopos nav identificētas mutācijas. Pretējā gadījumā var tikt ietekmēta antiviela.
3. Rezultāti
Mutācijas Omicron smaile ir potenciāli saistītas ar pašreizējo vakcīnu un uz antivielām balstītu terapijas līdzekļu efektivitātes samazināšanos. Mūsu SARS-CoV-2monklonālo antivielu datubāzē ar 132 struktūras apstiprinātu informāciju par 120 antivielu konformācijas epitopiem (S1 tabula) tikai četras antivielas var nodrošināt pilnīgu rezistenci pret Omicron smaile mutācijām, jo mutācijas netika konstatētas. identificēts pie epitopiem, kas saistīti ar šīm antivielām. Monoklonālo antivielu epitopus var klasificēt piecās antigēnu grupās: NTD [4], RBD-1, RBD-2, RBD-3 un RBD-4 [5] (attēls 1A–E).
1. attēls. SARS-CoV-2 Omicron mutācijas un dokumentēto monoklonālo antivielu epitopi. Epitopi piecās galvenajās antigēnu vietās (A) NTD, (B) RBD-1, (C) RBD-2, (D) RBD-3 un (E) RBD{{ 6}}. Omicron mutāciju skaits (# Omicron mut) parāda mutāciju skaitu katrā epitopā. Melnās kastes norāda uz Omicron smaiļu mutācijām. Sarkanie lodziņi apzīmē antivielas, kas var saglabāt efektivitāti pret Omicron. Pārtrauktais sarkanais lodziņš apzīmē vienu EY6A [7] epitopa veidu, kuram var būt pretestība. Epitopu klasifikācija ir balstīta uz Greaney AJ, et al. [5]. Epitopi un pārī savienotās antivielas ir uzskaitītas S1 tabulā. (F) Šajā pētījumā tiek analizēta detalizēta informācija par terapeitiskajām antivielām saskaņā ar ārkārtas lietošanas atļauju (EUA).
sistanch
Mēs analizējām Omicron smaile mutācijas pret šiem iepriekš identificētajiem epitopiem. Mūsu rezultāti liecina, ka mutācijas Omicron smaile dramatiski ietekmē NTD, RBD{{0}} un RBD-3, jo visas šo trīs grupu antivielas satur vienu vai vairākus epitopus, kurus ietekmē šīs mutācijas. (1.A–D attēls). Šajās grupās vidēji ir 2.00(standarta kļūda, sd 0.92), 3.29(sd,1.79) un 5.86(sd1.22) mutācijas, savukārt vidējais mutāciju skaits ir 1.14(sd1.19) URB-4 katram epitopam. Svarīgi, ka 4 antivielas, kuru mērķauditorija ir UBD-4, uzrāda pilnīgu rezistenci pret Omi-cron smaile mutācijām (1. E attēls). Trīs no tiem, tostarp S304 [8], COVOX-45 [9] un S2H97 [10], satur epitopus, kurus neietekmē Omicron smaile mutācijas. Ir pierādīts, ka lielākajai daļai šo antivielu ir augsta krusteniskās reakcijas spēja pret vairākiem SARS-CoV-2 GOS, SARS.CoV-1 vai pat panarbovīrusu. Tomēr otrs NE C126 nav neitralizējoša antiviela, lai gan tā var saistīties ar vairākiem satraucošiem proteīnu variantiem [11]. Neskatoties uz to, ir interesanti, ka visas antivielas ar pilnīgu rezistenci pret Omicron mutācijām ir vērstas uz RBD-4 antigēnu grupu.
No visām antivielām, kurām ir piešķirta ārkārtas lietošanas atļauja (EUA), mūsu datubāze liecina par Etesevimaba (LY-CoVO16)[12], Bamlanivimaba (LY-CoV555)[13], Casirivimaba (REGN10933), Imdevimaba (REGN10987)[14] neitralizācijas potenciālu, Cilgavimabs (AZD1061). Tiksagevimabs (AZD8895)[15], Sotrovimabs (Vir-7831 vai S309) [8,16] un Reg dzīvnieks (CT-P59)[17] var tikt nomierināts dažādās pakāpēs plašo Omikrona mutāciju dēļ. smaile (1.F attēls). Neatkarīgi no pētījuma tika ziņots par izteiktu vienas mutācijas ietekmi UBA, un dažas antivielas dramatiski ietekmēja viena mutācija [18]. Piemēram, tikai K417N mazina Etesevimaba neitralizējošu aktivitāti, un E484A ievērojami vājina Bamlanivimabu. Imdevimaba izraisīto neitralizāciju iznīcina tikai G446S [18]. Citas antivielas ietekmē vairākas mutācijas, savukārt šīs mutācijas kombinatorisko efektu var novērtēt tikai, pamatojoties uz vienu mutācijas efektu. Regdanvimabu var slāpēt K417N, E484A, Q493Rand Y505H Omicron kopā. Casirivimab izraisīto neitralizāciju var ietekmēt K417N, E484A un Q493R Omicron kopā, lai gan katra mutācija vidēji maina antigenitāti. S477N, T478K un E484A var nedaudz ietekmēt Tixagevimab. Par laimi, divas antivielas var tikai nedaudz ietekmēt Omicron smaile. Sotrovimabu var vājināt tikai G339D un N440K. N440K un G446S cilgavimabu var ietekmēt mēreni. Ir steidzami jāatjaunina pašreizējās terapeitiskās anti-body-cock-tails, lai cīnītos pret Omicron variantu.
4. Diskusija
Šajā pētījumā mēs analizējām mutācijas Omicron variantā pret 132 epitopiem no 120 zināmām antivielām. Mūsu analīze liecināja, ka četras no piecām antigēnu grupām ietekmē Omicron mutācijas. Tikai četras antivielas RBD-4 antigēnu grupā var palikt pilnībā rezistentas pret Omicron smaile mutācijām. Tā kā visās PVO [19] apstiprinātajās ārkārtas lietošanas (EUL) vakcīnās ir līdzīgs/identisks strukturālais pamats iepriekš minēto antivielu inducēšanai, mūsu analīze liecina par Omicron ietekmi uz pašreizējām terapeitiskajām antivielām ar Omicron smaili. mutācijas var attiekties arī uz strāvuCOVID-19 vakcīnas.
Mūsu analīze sniedz jaunu ieskatu vīrusu izbēgšanas aplēsēs, saskaroties ar jaunizveidoto SARS-CoV-2 variantu. Iepriekšējos pētījumos tika izmantoti neitralizācijas eksperimenti, lai apstiprinātu variantu aizbēgšanu. Lai iegūtu precīzus rezultātus, eksperimentālai apstiprināšanai bija nepieciešamas dažas nedēļas. Šāda kavēšanās pandēmijas laikā var kaitēt sabiedrībai. Mūsu analīze var piedāvāt ātras un precīzas prognozes, lai novērstu sabiedrības paniku. Tomēr pagātnes varianti ietekmēja tikai vienu vai divas dzīvībai svarīgas mutācijas smaile, kas ierobežo dziļu izpratni par mutāciju kombinatorisko efektu. Mūsu analīzē ir grūti sniegt visaptverošu kombinatoriskā efekta analīzi. Lai iegūtu precīzāku novērtējumu, vairāku mutāciju kombinatoriskais efekts būtu jāmodelē nākotnē, kad būs pieejami attiecīgie dati.
Mūsu analīze novērtēja Omicron varianta antigēnu nobīdi. Mūsu datubāzē ir piecas galvenās antigēnu grupas SARS-CoV smaile proteīnā-2. Tā kā mutācijas Omicron smaile pilnībā ietekmēja četras galvenās antigēnu grupas, tas liecināja, ka Omicron smailes antigenitāte ir krasi mainījusies, salīdzinot ar sākotnējo SARS-CoV -2 celmu. Iepriekšējie GOS ar antigēnu novirzi ietekmēja ne vairāk kā divas antigēnu grupas [5]. Alfa un Delta varianti ietekmēja attiecīgi UBR-1 un UBR-3, savukārt Beta un Gamma ietekmēja gan UBD-1, gan UBR-2 [5]. Šeit Omicron variants pilnībā mainīja NTD, RBD-1, RBD-2 un RBD-3 antigenitāti vienlaikus (1. attēls). Mūsu rezultāts liecināja, ka Omicron mutāciju radītā antigēnu nobīde radīja smailu proteīnu ar pilnīgi jaunām antigēnām iezīmēm. Neskatoties uz mūsu tūlītējo analīzi, ir jāveic turpmāki detalizēti eksperimenti, lai apstiprinātu Omicron antigēnu novirzi vai nobīdi, kā arī citu šo mutāciju ietekmi.
Mūsu atklājumi var sniegt ātras vadlīnijas nākamās paaudzes vakcīnu un terapeitisko antivielu izstrādei. Omicron smaile ar vairākām mutācijām uzrāda lielu līdzību ar mākslīgi konstruētā neitralizācijas rezistentā polimutanta [20], kas ievērojami vājināja aizsardzību pret vakcīnām un pagātnes infekciju un pat vakcināciju pēc inficēšanās. Ņemot vērā Omicron vai citu nākotnes variantu draudus, izstrādājot nākamās paaudzes vakcīnas vai antivielu terapiju pret SARS-CoV{7}}, būtu jāņem vērā efektīvas humorālās atbildes reakcijas ar plašu neitralizējošu darbību pret SARS-CoV.{9 }} varianti, kuru pamatā ir jaunākā vīrusu evolūcijas izsekošana. Mūsu analīze parādīja visas antivielas ar pilnīgu rezistenci pret mutācijām Omicron smaile mērķa UBR-4bet nekādas antivielas EUA mērķa UBD-4(1. attēls). Nākotnē, izmantojot terapeitisko antivielu kokteiļus, tas Labāk ir izmantot vairākas antivielas pret katru galveno antigēnu grupu, lai samazinātu vīrusu izkļūšanas risku vairāku mutāciju dēļ.
Svarīgi, ka ir ļoti svarīgi iegūt citas terapeitiskās vai aizsargājošās antivielas, kuru mērķis ir citi antigēni, izņemot SARS-CoV-2smailes proteīnu. Pat smaiļu proteīna gadījumā lielākā daļa pētnieku koncentrējas tikai uz URB domēnu. Mūsu datubāzē (S1 tabula) vairāk nekā puse antivielu (69 no 120) ir vērstas tikai uz URB-1 vai URB-2antigēnu grupu. Pārmērīga antivielu fokusēšana, kas mērķētas uz smailes proteīnu vai UBA pagātnē, var izraisīt Omicron vīrusa izkļūšanu tagadnē. Iespējams, ka evolūcijas spiediens uz smailes proteīnu izraisa Omicron varianta rašanos viena gada laikā pēc plaša mēroga vakcinācijas vairākās valstīs. Nākotnē labāk ir pievērst lielāku uzmanību citiem antigēniem, piemēram, nukleokapsīdam vai antigēniem no citiem atvērtiem lasīšanas kadriem. Vairākas antivielas, kuru mērķauditorija ir vairāki antigēni, var samazināt iespējamo antigēnu nobīdi vai novirzi jaunajos SARS-CoV{12}} variantos.
Turklāt nevajadzētu ignorēt aizsargājošo imunitāti no T šūnām, jo veselības aprūpes darbinieku [21] un T šūnu vakcīnu [22] pierādījumi liecina, ka T šūnu epitopi ir arī daudzsološi mērķi, lai izraisītu imūnreakciju pret SARS-CoV.{3}} . T šūnu epitopi ilgu laiku ir ignorēti, izstrādājot vakcīnas pret infekcijas slimībām. Pēdējos gados T šūnu epitopi ir izmantoti vēža vakcīnās, un agrīnās stadijas klīniskajā pētījumā tie ir izrādījuši daudzsološu efektivitāti [23]. Tā kā T šūnu epitopi tiek atpazīti bez sākotnējās konformācijas oriģinālajos antigēnos, uz T šūnu epitopiem balstītas vakcīnas var piedāvāt papildu aizsardzības slāņus pret vīrusu izkļūšanu [21]. Nākotnē labāk ir izstrādāt vakcīnas, kas provocē gan B šūnu, gan T šūnu veidošanos. imunitāte, lai aizsargātu pret antigēnu nobīdi vai jaunu variantu novirzi.
Visbeidzot, mūsu analīze ātri novērtēja Omicron mutāciju ietekmi uz 120 antivielām. Omicron mutācijas ietekmēja četras no piecām galvenajām antigēnu grupām smaile. Mūsu atklājumi arī parādīja, ka četras antivielas var palikt efektīvas pret SARS.CoV-2 Omicron variantu. Galu galā mūsu pētījums var vadīt turpmāko variantu antigēnu evolūcijas uzraudzību un nākamās paaudzes vakcīnu un terapeitisko antivielu izstrādi.
costanche
Atsauces
1. Pasaules Veselības organizācija. SARS-CoV-2 variantu izsekošana.
2. Tsang, AKL; Čens, PKC; Mak, GCK; Leung, PKL; Jā, PCW; Lam, ETK; Ng, KHL; Chan, RCW Honkongā konstatēts neparasts liels skaits proteīnu mutāciju SARS-CoV-2 celmiem. Dž.Klins. Virol. 2022, 20, 105081.
3. Pasaules Veselības organizācija. Omicron klasifikācija (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Bažas variants.
4. Tongs, P.; Gautam, A.; Vindzora, IW; Travers, M.; Čens, Y.; Garsija, N.; Vaitmens, NB; Makejs, LGA; Vētra, N.; Wesemann, DR; un citi. Atmiņas B šūnu repertuārs SARS-CoV-2 pieauguma atpazīšanai. Šūna 2021, 184, 4969–4980.e15.
5. Greinijs, AJ; Stārs, TN; Bārnsa, CO; Veisblums, Y.; Šmits, F.; Kaskijs, M.; Gaebler, C.; Hatziioannou, T.; Bieniasz, PD; Blūms, Dž. un citi. Mutāciju kartēšana SARS-CoV-2 UBR, kas izvairās no saistīšanās ar dažādām antivielu klasēm. Nat.Commun. 2021, 12, 4196. https://doi.org/10.1038/s41467-021-24435-8.
6. Ponomarenko, J.; Papangelopuls, N.; Zajonc, DM; Pēters, B.; Sette, A.; Bourne, PE IEDB-3D: Strukturālie dati imūnepitopu datubāzē. Nucleic Acids Res. 2011, 39, D1164–D1170.
7. Dejnirattisai, W.; Džou, D.; Supasa, P.; Liu, C.; Mencers, AJ; Džinna, HM; Džao, Y.; Duyvesteyn, HM; Tuekprakhon, A.; Nutella, R.; un citi. Antivielu izvairīšanās no SARS-CoV P.1 celma-2. Šūna 2021, 184, 2939–2954.e9.
8. Pinto, D.; Parks, YJ; Beltramello, M.; Sienas, AC; Tortorici, MA; Bjanki, S.; Jakoni, S.; Kulaps, K.; Zatta, F.; Korti, D.; un citi. SARS-CoV-2 krusteniskā neitralizācija ar cilvēka monoklonālu SARS-CoV antivielu. Daba 2020, 583., 290.–295.
9. Čens, RE; Džans, X.; Lieta, JB; Vinklers, ES; Liu, Y.; VanBlargan, LA; Liu, J.; Erriko, Dž. M.; Xie, X.; Dimants, MS; un citi. SARS-CoV-2 variantu rezistence pret neitralizāciju ar monoklonālām un no seruma iegūtām poliklonālām antivielām. Nat. Med. 2021, 27, 717–726.
10. Starr, TN; Czudnochowski, N.; Liu, Z.; Zatta, F.; Parks, YJ; Addetija, A.; Pinto, D.; Beltramello, M.; Hernandess, P.; Snell, G.; un citi. SARS-CoV-2 URB antivielas, kas palielina platumu un izturību pret izplūdi. Daba 2021, 597, 97–102.
11. Čens, EK; Giļčuks, P.; Zost, SJ; Surjadevara, N.; Vinklers, ES; Kabelis, CR; Bernšteins, E.; Čens, RE; Satons, RE; Crowe Jr, JE; un citi. Konverģentas antivielu atbildes reakcijas pret SARS-CoV-2 smago proteīnu atveseļošanās periodā un vakcinētiem indivīdiem. Šūnas Rep.2021, 36, 109604.
12. Starr, TN; Grīnijs, AJ; Dingens, AS; Blūms, JD Pilna SARS-CoV-2 UBR mutāciju karte, kas izvairās no monoklonālās antivielas LY-CoV555 un tās kokteiļa ar LY-CoV016. Cell Rep. Med. 2021, 2, 100255.
13. Džounss, Beļģija; Brown-Augsburger, PL; Korbets, KS; Vestendorfs, K.; Deiviss, Dž.; Kujeks, TP; Vītofs, CM; Blekborna, JL; Heincs, BA; Fosters, D.; un citi. Neitralizējošā antiviela LY-CoV555 aizsargā pret SARS-CoV-2 infekciju primātiem, kas nav cilvēkveidīgie primāti. Sci. Tulk. Med. 2021, 13, eabf1906.
14. Hansens, J.; Baums, A.; Paskāls, KE; Russo, V.; Džordāno, S.; Vloga, E.; Fulton, BO; Jans, Y.; Kūns, K.; Patels, K.; un citi. Pētījumos ar humanizētām pelēm un cilvēkiem, kas atveseļojas, tika iegūts SARS-CoV-2 antivielu kokteilis. Zinātne 2020, 369, 1010–1014.
15. Dongs, Dž.; Zost, SJ; Grīnijs, AJ; Stārs, TN; Dingens, AS; Čena, EK; Čens, RE; Lieta, JB; Satons, RE; Giļčuks, P.; un citi. Ģenētiskais un strukturālais pamats SARS-CoV-2 varianta neitralizēšanai ar divu antivielu kokteili. Nat. Microbiol. 2021, 6, 1233–1244.
16. Pikoli, L.; Park, Y.-J.; Tortorici, MA; Czudnochowski, N.; Sienas, AC; Beltramello, M.; Silacci-Fregni, C.; Pinto, D.; Rozens, LE; Bowen, JE; un citi. Neitralizējošo un imūndominējošo vietu kartēšana SARS-CoV-2 smaiļu receptoru saistošajā domēnā, izmantojot strukturāli vadītu augstas izšķirtspējas seroloģiju. Šūna 2020, 183, 1024–1042.e21.
17. Kims, C.; Ryu, D.-K.; Lī, Dž.; Kims, Y.-I.; Seo, J.-M.; Kims, Y.-G.; Džeongs, J.-H.; Kims, M.; Kims, J.-I.; Kims, P.; un citi. Terapeitiski neitralizējoša antiviela, kas vērsta uz SARS-CoV-2 smaile proteīna receptoru saistošo domēnu. Nat. Commun. 2021, 12, 288.
18. Greinijs, AJ; Stārs, TN; Giļčuks, P.; Zost, SJ; Bernšteins, E.; Loes, AN; Hiltone, SK; Hadlstons, Dž. Egija, R.; Kroforda, KH; un citi. Pilnīga SARS-CoV-2 smailes receptoru saistošā domēna mutāciju kartēšana, kas ļauj izvairīties no antivielu atpazīšanas. Šūnu saimniekmikrobi 2021, 29, 44–57.e9.
19. Pasaules Veselības organizācija. Covid-19 vakcīnu statuss PVO EUL/PQ novērtēšanas procesā. Pieejams tiešsaistē:
20. Šmits, F.; Veisblums, Y.; Rutkovska, M.; Postons, D.; Da Silva, J.; Džans, F.; Bednarskis, E.; Čo, A.; Šēfers-Babajevs, dīdžejs; Gaebler, C.; un citi. Augsta ģenētiskā barjera SARS-CoV-2 poliklonālo neitralizējošu antivielu izkļūšanai. Daba 2021, 600, 512–516.
21. Swadling, L.; Dinizs, MO; Šmits, NM; Amins, OE; Čandrans, A.; Šovs, E.; Pade, C.; Gibons, Dž. M.; Le Bērts, N.; Tan, AT; un citi. Iepriekš esošās polimerāzei specifiskās T šūnas izplešas abortīvā seronegatīvā SARS-CoV-2 gadījumā. Daba 2022, 601, 110–117.
22. Heitmans, J. S.; Biličs, T.; Tandlers, C.; Nelde, A.; Māringers, Y.; Markonato, M.; Reušs, J.; Jēgers, S.; Denks, M.; Rihters, M.; et al. COVID-19 peptīdu vakcīna SARS-CoV-2 T šūnu imunitātes ierosināšanai. Daba 2021, 601, 617–622.
23. Ott, PA; Hu-Lieskovan, S.; Chmielovskis, B.; Govindans, R.; Naing, A.; Bhardvajs, N.; Margolina, K.; Avads, MM; Helmans, MD; Līns, Dž. un citi. Personalizētas neoantigēnu terapijas plus anti-PD-1 Ib fāzes izmēģinājums pacientiem ar progresējošu melanomu,
Nesīkšūnu plaušu vēzis jeb urīnpūšļa vēzis. Šūna 2020, 183, 347–362.e24.